分子系统生物学研究中心面向人口健康和现代农业两大国家战略需求，依托生物信息学、蛋白质组学、结构生物学、进化遗传学、系统生物学等多学科交叉研究方法，从遗传网络及其关键元件解析的角度，着重开展多种组学数据的分析方法开发与数据挖掘，生物大分子组装、修饰及动态变化，生物系统的稳定性调控，类器官制造与器官分化机制解析等生命科学领域前沿科学问题的研究。中心目前有6个研究组，研究队伍包括获“国家杰出青年科学基金”支持1名，获“国家优秀青年科学基金”支持3名，中科院“BR计划”3名。中心致力于打造一个集人才培养与科技创新为一体的高水平研究平台，为攻克生命科学研究领域重大与前沿科学问题做出贡献。